因業(yè)務(wù)調(diào)整，部分個人測試暫不接受委托，望見諒。

檢測項目

總RNA提取與質(zhì)控：評估RNA純度（OD260/280≥1.8，OD260/230≥2.0）、完整性（RIN值≥7.0，DV200≥50%）及濃度（檢出限0.1ng/μL）。

mRNA文庫構(gòu)建：檢測文庫片段大小分布（主峰200-500bp）、接頭連接效率（>80%）及文庫濃度（≥2nM）。

高通量測序：采用Illumina平臺進行雙端測序（PE150），單樣本數(shù)據(jù)量≥6Gb，Q30≥85%，錯誤率<0.1%。

原始數(shù)據(jù)質(zhì)控：FastQC評估Reads質(zhì)量值分布、GC含量異常檢測及接頭污染率（<5%）。

參考基因組比對：采用HISAT2/STAR進行序列定位，比對率≥70%，唯一比對率≥60%。

基因表達定量：基于featureCounts計算FPKM/TPM值，檢測靈敏度0.01FPKM。

差異表達分析：DESeq2/edgeR篩選差異基因（|log2FC|≥1且FDR<0.05）。

可變剪接分析：rMATS檢測外顯子跳躍、內(nèi)含子保留等事件（FDR<0.05，IncLevelDifference≥0.1）。

融合基因檢測：STAR-Fusion識別染色體易位事件（支持reads≥5）。

功能富集分析：GO/KEGG通路注釋（超幾何檢驗FDR<0.05）。

SNP/InDel檢測：GATK流程識別變異位點（測序深度≥30X，變異質(zhì)量值QUAL≥50）。

lncRNA鑒定：CPC2/phastCons預(yù)測新非編碼RNA（長度>200nt，ORF<100aa）。

檢測范圍

動物組織樣本：哺乳動物器官、胚胎組織及腫瘤樣本（最小起始量10mg組織）。

植物材料：農(nóng)作物葉片、根莖及脅迫處理樣本（需特殊多糖多酚去除方案）。

細胞培養(yǎng)物：原代細胞、細胞系及類器官培養(yǎng)系統(tǒng)（細胞數(shù)≥1×10?）。

血液成分：全血、PBMC及血漿游離RNA（游離RNA富集方案）。

微生物群落：環(huán)境宏轉(zhuǎn)錄組樣本（16S rRNA去除率>99%）。

醫(yī)學(xué)病理樣本：福爾馬林固定石蠟包埋組織（FFPE，片段化處理）。

單細胞懸液：適用于10x Genomics平臺的單細胞轉(zhuǎn)錄組分析（細胞活性>85%）。

病原體感染模型：宿主-病原體互作轉(zhuǎn)錄組研究（病原特異性探針富集）。

發(fā)育時序樣本：胚胎不同發(fā)育階段動態(tài)表達譜分析（時間分辨率達小時級）。

藥物處理組：藥效評價及毒性機制研究（設(shè)置梯度濃度與時間點）。

轉(zhuǎn)基因生物：基因編輯效率驗證及脫靶效應(yīng)評估（sgRNA特異性分析）。

古生物樣本：降解RNA的特殊建庫方案（需uracil-DNA糖基化酶處理）。

檢測標(biāo)準(zhǔn)

ISO 20395:2019 生物技術(shù)-核酸測序方法學(xué)驗證要求

GB/T 34797-2017 高通量基因測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評價指南

EN ISO 18115-2:2021 生物樣本庫RNA質(zhì)量規(guī)范

CLSI MM19-A2 臨床高通量測序驗證標(biāo)準(zhǔn)

GB/T 37872-2019 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析流程規(guī)范

ISO/IEC 17025:2017 檢測實驗室通用能力要求

MIQE指南：實時熒光定量PCR實驗規(guī)范（Clin Chem 55:4,2009）

RNA測序質(zhì)量控制聯(lián)盟標(biāo)準(zhǔn)（Nat Biotechnol 32:903,2014）

GB/T 30988-2014 多酚多糖植物材料RNA提取方法

FASTQ格式規(guī)范：Illumina標(biāo)準(zhǔn)1.8+（Phred+33編碼）

檢測儀器

Illumina NovaSeq 6000高通量測序系統(tǒng)：通量達20B reads/run，支持PE150測序模式，用于全轉(zhuǎn)錄組深度覆蓋。

Agilent 4200 TapeStation系統(tǒng)：配備高靈敏度RNA ScreenTape，精確測定RIN值（分辨率0.1）及片段分布。

Qubit 4.0熒光計：采用高特異性RNA HS檢測試劑，濃度測量精度±5%（范圍0.05-100ng/μL）。

Covaris M220聚焦超聲儀：參數(shù)化控制片段化（峰值功率50W，占空比10%，循環(huán)數(shù)200），確保c文庫片段均一性。

Bio-Rad CFX96 Touch qPCR系統(tǒng)：執(zhí)行文庫定量（KAPA SYBR? Fast試劑盒，R2>0.99）及質(zhì)控檢測。

Nanopore PromethION平臺：支持直接RNA測序，讀長>10kb，用于全長轉(zhuǎn)錄本分析。

Beckman Coulter Biomek i7自動化工作站：實現(xiàn)96孔板并行RNA提取，通量800樣本/日，CV<8%。

ABI QuantStudio 12K Flex系統(tǒng)：執(zhí)行基因表達驗證（TaqMan探針法，動態(tài)范圍10?）。

PerkinElmer Chemagic 360系統(tǒng)：磁珠法核酸自動純化（回收率>85%，處理量192樣本/批次）。

Eppendorf Mastercycler X50 PCR儀：配備熱蓋梯度功能，確保cDNA合成溫度精度±0.1℃。

檢測流程

1、咨詢：提品資料(說明書、規(guī)格書等)

2、確認(rèn)檢測用途及項目要求

3、填寫檢測申請表(含公司信息及產(chǎn)品必要信息)

4、按要求寄送樣品(部分可上門取樣/檢測)

5、收到樣品，安排費用后進行樣品檢測

6、檢測出相關(guān)數(shù)據(jù)，編寫報告草件，確認(rèn)信息是否無誤

7、確認(rèn)完畢后出具報告正式件

8、寄送報告原件