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成分分析,配方還原,食品檢測(cè),藥品檢測(cè),化妝品檢測(cè),環(huán)境檢測(cè),性能檢測(cè),耐熱性檢測(cè),安全性能檢測(cè),水質(zhì)檢測(cè),氣體檢測(cè),工業(yè)問(wèn)題診斷,未知成分分析,塑料檢測(cè),橡膠檢測(cè),金屬元素檢測(cè),礦石檢測(cè),有毒有害檢測(cè),土壤檢測(cè),msds報(bào)告編寫等。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析檢測(cè)

發(fā)布時(shí)間:2025-06-30

關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析測(cè)試周期,轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析測(cè)試儀器,轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析項(xiàng)目報(bào)價(jià)

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來(lái)源:北京中科光析科學(xué)技術(shù)研究所

文章簡(jiǎn)介:

轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析檢測(cè)是一項(xiàng)專業(yè)的生物檢測(cè)技術(shù),專注于全面解析生物樣本中RNA轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)譜和多樣性。核心檢測(cè)要點(diǎn)包括RNA提取純度控制、高通量測(cè)序?qū)嵤⒒虮磉_(dá)量化、差異分析及功能注釋等步驟,確保數(shù)據(jù)的精確性、可重復(fù)性和標(biāo)準(zhǔn)化輸出。本檢測(cè)廣泛應(yīng)用于科研探索、疾病機(jī)制研究及生物技術(shù)開(kāi)發(fā)領(lǐng)域,遵循嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)室規(guī)程和質(zhì)量控制體系。
點(diǎn)擊咨詢

因業(yè)務(wù)調(diào)整,部分個(gè)人測(cè)試暫不接受委托,望見(jiàn)諒。

檢測(cè)項(xiàng)目

RNA提取與純化:基于硅膠柱或磁珠法分離總RNA,純度參數(shù)A260/A280>1.8,濃度范圍>50ng/μl,回收率>90%。

RNA完整性檢測(cè):通過(guò)電泳或自動(dòng)化平臺(tái)評(píng)估RIN值(RNA Integrity Number),標(biāo)準(zhǔn)范圍1-10,要求>7,片段大小分布均勻。

cDNA合成:使用逆轉(zhuǎn)錄酶催化,反應(yīng)參數(shù)包括溫度42℃,時(shí)間60分鐘,效率>95%,避免降解。

文庫(kù)構(gòu)建:片段化后加接頭,片段大小200-500bp,接頭連接效率>80%,文庫(kù)濃度>10nM。

高通量測(cè)序:執(zhí)行雙端測(cè)序,測(cè)序深度≥30百萬(wàn)reads,讀長(zhǎng)150bp,錯(cuò)誤率<0.1%,Q-score>30。

序列比對(duì)與映射:參考基因組比對(duì)率>80%,容許誤差<2%,使用標(biāo)準(zhǔn)算法如STAR或HISAT2。

基因表達(dá)量化:計(jì)算FPKM或TPM值,靈敏度達(dá)0.1TPM,覆蓋所有編碼基因和非編碼RNA。

差異表達(dá)分析:識(shí)別上下調(diào)基因,參數(shù)fold change≥2,p-value<0.05,F(xiàn)DR校正后<0.1。

功能富集分析:進(jìn)行GO、KEGG通路富集,p-value<0.05,覆蓋生物學(xué)過(guò)程、分子功能和細(xì)胞組分。

可變剪接檢測(cè):分析剪切事件類型(如外顯子跳躍),事件數(shù)目>1000,置信度>90%。

SNP和變異鑒定:檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性,變異頻率>5%,準(zhǔn)確性>99%,覆蓋全轉(zhuǎn)錄組。

融合基因分析:識(shí)別染色體易位事件,支持reads數(shù)>5,假陽(yáng)性率<1%。

表達(dá)定量驗(yàn)證:通過(guò)qPCR復(fù)核,相關(guān)系數(shù)R2>0.9,變異系數(shù)<10%。

新轉(zhuǎn)錄本發(fā)現(xiàn):de novo拼接長(zhǎng)度>200bp,組裝完整性BUSCO>80%。

檢測(cè)范圍

人類組織樣本:包括腫瘤、器官和血液,用于癌癥分子分型和疾病機(jī)制研究。

動(dòng)物模型樣本:如小鼠或大鼠組織,在藥理毒理學(xué)和基因功能驗(yàn)證中應(yīng)用。

植物樣本:涵蓋葉片、根系和種子,研究環(huán)境脅迫響應(yīng)和遺傳改良。

微生物群體:包括細(xì)菌、真菌群落,分析病原體轉(zhuǎn)錄組和抗生素耐藥性。

細(xì)胞培養(yǎng)物:如干細(xì)胞或癌細(xì)胞系,用于細(xì)胞信號(hào)通路研究和藥物篩選。

臨床診斷樣本:涉及體液、活檢組織,支持疾病biomarker發(fā)現(xiàn)和個(gè)性化醫(yī)療。

環(huán)境樣本:如土壤或水體微生物,監(jiān)測(cè)生態(tài)毒性和生物多樣性變化。

食品樣本:包括肉類、蔬菜,檢測(cè)食源性病原體污染和食品安全評(píng)估。

醫(yī)藥研發(fā)材料:在藥物靶點(diǎn)識(shí)別和藥效評(píng)價(jià)中,涵蓋候選化合物處理樣本。

農(nóng)業(yè)生物技術(shù)產(chǎn)品:如轉(zhuǎn)基因作物,優(yōu)化產(chǎn)量和抗逆性狀的表型關(guān)聯(lián)分析。

免疫學(xué)樣本:涉及淋巴細(xì)胞或血清,研究炎癥反應(yīng)和疫苗開(kāi)發(fā)。

神經(jīng)科學(xué)樣本:如腦組織,探索神經(jīng)退行性疾病機(jī)制和認(rèn)知功能。

發(fā)育生物學(xué)樣本:涵蓋胚胎或組織分化階段,分析發(fā)育時(shí)序基因調(diào)控。

檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)

依據(jù)ISO/IEC 17025:2017實(shí)施實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量管理體系,確保數(shù)據(jù)可追溯性。

遵循MINSEQE指南報(bào)告高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn),包括樣本制備和數(shù)據(jù)分析細(xì)節(jié)。

GB/T 34796-2017規(guī)范核酸定量方法,精度誤差<5%,波長(zhǎng)260nm。

ASTM E3135-18規(guī)定生物樣本處理規(guī)程,涵蓋存儲(chǔ)溫度-80℃和運(yùn)輸條件。

ISO 20391-1:2018定義細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制參數(shù),變異系數(shù)<15%。

GB/T 30988-2014管理RNA提取純化流程,回收率標(biāo)準(zhǔn)>85%。

EN ISO 15216-1:2017指導(dǎo)微生物檢測(cè),應(yīng)用于病原體轉(zhuǎn)錄組分析。

ISO 5725-2:2019確保檢測(cè)方法精確度,偏差范圍<10%。

GB/T 27404-2008規(guī)范實(shí)驗(yàn)室能力驗(yàn)證,覆蓋重復(fù)性和再現(xiàn)性測(cè)試。

ASTM WK65021草案用于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化,消除批次效應(yīng)。

檢測(cè)儀器

高通量測(cè)序系統(tǒng):執(zhí)行RNA測(cè)序功能,讀長(zhǎng)150bp,通量>1TB數(shù)據(jù)/運(yùn)行,支持深度分析。

實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀:用于基因表達(dá)驗(yàn)證,靈敏度0.1拷貝,動(dòng)態(tài)范圍10?,確保結(jié)果復(fù)核。

生物分析儀:評(píng)估RNA完整性,分辨率1-10000nt,輸出RIN值,質(zhì)量控制核心設(shè)備。

分光光度計(jì):測(cè)量核酸濃度,波長(zhǎng)范圍190-800nm,精度±5%,樣本處理基礎(chǔ)工具。

高速離心機(jī):樣本制備功能,轉(zhuǎn)速>15000rpm,離心力>20000g,保障RNA純化效率。

自動(dòng)化液體處理系統(tǒng):執(zhí)行試劑分配,精度0.1μl,減少人為誤差,提升通量。

服務(wù)器集群:生物信息學(xué)分析功能,計(jì)算能力>100TFLOPS,運(yùn)行比對(duì)和量化算法。

冷凍儲(chǔ)存設(shè)備:樣本保存,溫度-80℃,穩(wěn)定性>5年,防止RNA降解。

電泳系統(tǒng):可視化RNA片段,電壓范圍50-300V,分辨率高,完整性初篩工具。

酶標(biāo)儀:檢測(cè)濃度和純度,波長(zhǎng)精度±1nm,高通量樣本篩查設(shè)備。

檢測(cè)流程

1、咨詢:提品資料(說(shuō)明書、規(guī)格書等)

2、確認(rèn)檢測(cè)用途及項(xiàng)目要求

3、填寫檢測(cè)申請(qǐng)表(含公司信息及產(chǎn)品必要信息)

4、按要求寄送樣品(部分可上門取樣/檢測(cè))

5、收到樣品,安排費(fèi)用后進(jìn)行樣品檢測(cè)

6、檢測(cè)出相關(guān)數(shù)據(jù),編寫報(bào)告草件,確認(rèn)信息是否無(wú)誤

7、確認(rèn)完畢后出具報(bào)告正式件

8、寄送報(bào)告原件

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