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成分分析,配方還原,食品檢測,藥品檢測,化妝品檢測,環(huán)境檢測,性能檢測,耐熱性檢測,安全性能檢測,水質(zhì)檢測,氣體檢測,工業(yè)問題診斷,未知成分分析,塑料檢測,橡膠檢測,金屬元素檢測,礦石檢測,有毒有害檢測,土壤檢測,msds報告編寫等。

普通轉(zhuǎn)錄組測序檢測

發(fā)布時間:2025-07-01

關鍵詞:普通轉(zhuǎn)錄組測序項目報價,普通轉(zhuǎn)錄組測序測試周期,普通轉(zhuǎn)錄組測序測試儀器

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來源:北京中科光析科學技術(shù)研究所

文章簡介:

普通轉(zhuǎn)錄組測序檢測通過高通量測序技術(shù)分析生物樣本中RNA的表達譜,用于研究基因表達水平、剪接變異和功能注釋。檢測要點包括RNA質(zhì)量評估、文庫構(gòu)建質(zhì)量控制、測序數(shù)據(jù)準確性和生物信息學分析流程驗證,確保數(shù)據(jù)可靠性和可重復性。
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因業(yè)務調(diào)整,部分個人測試暫不接受委托,望見諒。

檢測項目

RNA完整性檢測:評估RNA降解程度,RIN值范圍1-10,檢測參數(shù)要求RIN≥7.0。

RNA純度檢測:測量A260/A280和A260/A230比值,參數(shù)標準A260/A280=1.8-2.0,A260/A230≥2.0。

RNA濃度檢測:使用熒光法量化,檢測范圍0.1-1000 ng/μl,精度誤差≤5%。

文庫構(gòu)建效率:評估cDNA合成和片段化效果,參數(shù)包括文庫大小分布200-700 bp,產(chǎn)量≥50 ng。

測序深度控制:計算平均覆蓋深度,參數(shù)要求≥30X,確?;虮磉_定量準確性。

映射率分析:比對reads到參考基因組的比例,參數(shù)標準≥90%,誤差率≤0.1%。

基因表達定量:計算FPKM或TPM值,檢測范圍0-10^6,重復性相關系數(shù)≥0.95。

差異表達分析:識別差異基因,參數(shù)包括p值≤0.05,log2 fold change≥1。

剪接變異檢測:鑒定可變剪接事件,參數(shù)要求支持reads數(shù)≥10,覆蓋度≥80%。

新轉(zhuǎn)錄本鑒定:發(fā)現(xiàn)未注釋轉(zhuǎn)錄本,參數(shù)包括開放閱讀框預測和保守性評分≥0.7。

功能富集分析:評估基因功能類別,參數(shù)包括GO富集p值≤0.01,KEGG通路覆蓋。

質(zhì)量控制指標:監(jiān)測測序錯誤率,參數(shù)如Q30百分比≥85%,堿基質(zhì)量≥30。

檢測范圍

人類組織樣本:包括新鮮或冷凍的器官如肝臟、腦組織,用于癌癥研究和疾病機制探索。

動物模型樣本:如小鼠、大鼠的器官或血液,支持藥物毒理學和遺傳學研究。

細胞培養(yǎng)物:包括癌細胞系或干細胞,應用于基因調(diào)控和細胞響應分析。

植物樣本:如葉片、根或種子,用于作物改良和脅迫響應研究。

微生物樣本:包括細菌、酵母的RNA,應用于環(huán)境微生物組和工業(yè)發(fā)酵。

臨床樣本:如血液、唾液或活檢組織,用于診斷標志物發(fā)現(xiàn)和個性化醫(yī)療。

環(huán)境樣本:包括土壤、水體中的RNA,研究微生物群落動態(tài)和污染響應。

藥物處理樣本:如化學試劑處理的細胞,評估藥物效應和基因表達變化。

發(fā)育階段樣本:如胚胎或幼蟲組織,支持發(fā)育生物學和時序表達分析。

疾病模型樣本:如腫瘤或感染組織,用于病理機制和靶點篩選。

合成生物學產(chǎn)品:如工程化RNA分子,驗證基因電路功能和穩(wěn)定性。

食品與農(nóng)業(yè)產(chǎn)品:如轉(zhuǎn)基因作物,監(jiān)測基因表達合規(guī)性和安全性。

檢測標準

依據(jù)ISO 20391-1:2018進行RNA測序質(zhì)量控制,規(guī)范測序深度和錯誤率參數(shù)。

遵循GB/T 34798-2017高通量測序技術(shù)規(guī)范,覆蓋文庫構(gòu)建和數(shù)據(jù)分析要求。

采用ASTM E3136-18標準評估RNA完整性檢測方法,確保RIN值可靠性。

參考ISO 5725-2:2019精度和重復性標準,用于基因表達定量驗證。

應用GB/T 35434-2017生物信息學分析指南,規(guī)定差異表達和功能富集流程。

依據(jù)ENCODE項目標準進行映射率和剪接變異分析,確保數(shù)據(jù)可比性。

檢測儀器

高通量測序儀:如NovaSeq系列,采用邊合成邊測序技術(shù),通量高達20億reads/run,用于生成原始測序數(shù)據(jù)。

生物分析儀:如Bioanalyzer系統(tǒng),通過微流體芯片評估RNA完整性和文庫大小,檢測范圍35-10000 bp。

熒光定量儀:如Qubit設備,使用熒光染料測量RNA濃度,精度達0.1 ng/μl,支持低樣本量檢測。

PCR擴增儀:如熱循環(huán)儀,執(zhí)行文庫擴增步驟,溫度控制精度±0.1°C,確保擴增效率。

生物信息學軟件:如STAR比對工具,處理測序reads映射,支持多線程分析,功能包括變異檢測。

電泳系統(tǒng):如毛細管電泳儀,驗證RNA片段分布,分辨率達1 bp,用于質(zhì)量控制。

檢測流程

1、咨詢:提品資料(說明書、規(guī)格書等)

2、確認檢測用途及項目要求

3、填寫檢測申請表(含公司信息及產(chǎn)品必要信息)

4、按要求寄送樣品(部分可上門取樣/檢測)

5、收到樣品,安排費用后進行樣品檢測

6、檢測出相關數(shù)據(jù),編寫報告草件,確認信息是否無誤

7、確認完畢后出具報告正式件

8、寄送報告原件

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