因業(yè)務(wù)調(diào)整，部分個(gè)人測(cè)試暫不接受委托，望見(jiàn)諒。

檢測(cè)項(xiàng)目

樣品RNA完整性檢測(cè)：評(píng)估RNA降解程度，參數(shù)如RIN值≥7.0，使用Agilent 2100系統(tǒng)兼容方法。

RNA濃度和純度檢測(cè)：測(cè)定吸光度比例，參數(shù)260/280 nm比值1.8-2.0，260/230 nm比值≥2.0。

文庫(kù)大小分布檢測(cè)：分析片段大小均勻性，參數(shù)平均大小300-500 bp，標(biāo)準(zhǔn)差<50 bp。

文庫(kù)濃度檢測(cè)：定量構(gòu)建后文庫(kù)含量，參數(shù)≥10 nM，使用熒光染料結(jié)合法。

測(cè)序深度檢測(cè)：確保每個(gè)樣本覆蓋度，參數(shù)≥30 million reads per sample，平均深度≥20×。

映射率檢測(cè)：計(jì)算reads映射到參考基因組比例，參數(shù)≥85%，使用Bowtie2或STAR比對(duì)工具。

基因表達(dá)水平檢測(cè)：量化FPKM或TPM值，參數(shù)檢測(cè)范圍0.01-1000，精度±0.1。

差異表達(dá)基因檢測(cè)：識(shí)別顯著變化基因，參數(shù)|log2FC|≥1，調(diào)整p值<0.05，包含DESeq2算法。

可變剪接檢測(cè)：分析剪接變異事件，參數(shù)junction reads支持?jǐn)?shù)≥5，覆蓋度≥10×。

RNA編輯檢測(cè)：識(shí)別堿基編輯位點(diǎn)，參數(shù)編輯頻率≥0.05，使用GATK變異調(diào)用。

GC含量偏差檢測(cè)：評(píng)估文庫(kù)GC偏倚，參數(shù)GC含量40-60%，偏差值<5%。

接頭污染檢測(cè)：篩查非目標(biāo)序列污染，參數(shù)接頭率<0.1%，使用FastQC質(zhì)量控制。

重復(fù)性檢測(cè)：評(píng)估樣本間一致性，參數(shù)Pearson相關(guān)系數(shù)≥0.9。

基因融合檢測(cè)：篩查基因組重排事件，參數(shù)融合reads支持?jǐn)?shù)≥3。

新轉(zhuǎn)錄本檢測(cè)：識(shí)別未知轉(zhuǎn)錄本，參數(shù)覆蓋連續(xù)性≥80%，使用StringTie組裝。

檢測(cè)范圍

腫瘤研究：分析癌癥樣本的基因表達(dá)特征，用于標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)和治療靶點(diǎn)篩選。

神經(jīng)科學(xué)：研究腦組織轉(zhuǎn)錄組變化，應(yīng)用于阿爾茨海默病和帕金森病機(jī)制探索。

傳染病響應(yīng)：監(jiān)測(cè)宿主對(duì)病毒或細(xì)菌感染的基因表達(dá)動(dòng)態(tài)，如COVID-19宿主響應(yīng)分析。

農(nóng)業(yè)育種：評(píng)估作物在干旱或病蟲(chóng)害脅迫下的轉(zhuǎn)錄響應(yīng)，優(yōu)化抗逆性狀。

藥物開(kāi)發(fā)：篩選藥物對(duì)細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的影響，支持毒理學(xué)和藥效學(xué)評(píng)估。

發(fā)育生物學(xué)：追蹤胚胎或器官發(fā)育階段的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，解析形態(tài)發(fā)生機(jī)制。

干細(xì)胞研究：監(jiān)測(cè)干細(xì)胞分化過(guò)程中的表達(dá)譜變化，用于再生醫(yī)學(xué)應(yīng)用。

環(huán)境毒理學(xué)：分析污染物暴露對(duì)生物轉(zhuǎn)錄組的擾動(dòng)，評(píng)估生態(tài)風(fēng)險(xiǎn)。

個(gè)性化醫(yī)療：開(kāi)發(fā)患者特異性基因表達(dá)圖譜，指導(dǎo)定制化治療方案。

食品安全：檢測(cè)食品中病原體或過(guò)敏原的RNA表達(dá)，確保產(chǎn)品安全合規(guī)。

免疫學(xué)研究：探索免疫細(xì)胞激活狀態(tài)的轉(zhuǎn)錄特征，用于疫苗開(kāi)發(fā)。

植物生理學(xué)：研究光合作用或脅迫響應(yīng)的基因表達(dá)模式，提升作物產(chǎn)量。

微生物組分析：評(píng)估微生物群落功能性轉(zhuǎn)錄活動(dòng)，解析共生機(jī)制。

衰老研究：分析年齡相關(guān)基因表達(dá)變化，探索抗衰老干預(yù)策略。

罕見(jiàn)病診斷：識(shí)別遺傳疾病中的異常表達(dá)基因，輔助臨床診斷。

檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)

依據(jù)ISO 20395:2018生物技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)，規(guī)范下一代測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量參數(shù)和評(píng)估方法。

遵循GB/T 30988-2014高通量基因測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量規(guī)范，確保數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性和可比性。

采用ASTM E2655-14核酸序列質(zhì)量評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)指南，指導(dǎo)測(cè)序錯(cuò)誤率控制。

參照ISO/IEC 17025:2017測(cè)試和校準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室能力要求，保證檢測(cè)過(guò)程標(biāo)準(zhǔn)化。

應(yīng)用ENCODE項(xiàng)目指南，設(shè)定功能基因組學(xué)數(shù)據(jù)質(zhì)量控制參數(shù)。

依據(jù)GB/T 1.1-2020標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則，制定檢測(cè)報(bào)告格式和內(nèi)容規(guī)范。

采用MIAME標(biāo)準(zhǔn)，規(guī)范基因表達(dá)數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)和存儲(chǔ)要求。

參照ISO 9001:2015質(zhì)量管理體系，實(shí)施全面質(zhì)量控制流程。

依據(jù)FAIR數(shù)據(jù)原則，確保檢測(cè)數(shù)據(jù)可尋、可訪問(wèn)、互操作和可重用。

采用NIH數(shù)據(jù)共享政策，規(guī)范轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的公開(kāi)和倫理合規(guī)。

檢測(cè)儀器

高通量DNA測(cè)序儀：執(zhí)行大規(guī)模并行測(cè)序，功能為生成RNA文庫(kù)的reads數(shù)據(jù)，支持雙端測(cè)序模式。

生物分析儀：評(píng)估樣品RNA完整性和文庫(kù)大小分布，功能包括RIN值計(jì)算和片段分析。

熒光定量?jī)x：精確測(cè)量RNA濃度和文庫(kù)產(chǎn)量，功能為熒光染料結(jié)合定量，精度±5%。

熱循環(huán)儀：執(zhí)行逆轉(zhuǎn)錄和PCR擴(kuò)增步驟，功能包括cDNA合成和文庫(kù)擴(kuò)增，溫度控制精度±0.1°C。

自動(dòng)化液體處理系統(tǒng)：高效處理樣品制備流程，功能實(shí)現(xiàn)移液和混合標(biāo)準(zhǔn)化，減少人為誤差。

凝膠電泳系統(tǒng)：可視化檢測(cè)RNA和文庫(kù)片段大小，功能用于初步質(zhì)量篩查。

實(shí)時(shí)定量PCR儀：驗(yàn)證特定基因表達(dá)水平，功能提供高靈敏度檢測(cè)，Ct值重復(fù)性±0.5。

離心機(jī)：分離和純化核酸樣品，功能實(shí)施高速離心操作，rpm范圍500-15000。

恒溫水浴槽：維持反應(yīng)溫度穩(wěn)定性，功能確保酶反應(yīng)效率，溫度波動(dòng)±0.5°C。

數(shù)據(jù)存儲(chǔ)服務(wù)器：處理和分析大規(guī)模測(cè)序數(shù)據(jù)，功能支持并行計(jì)算和云存儲(chǔ)集成。

檢測(cè)流程

1、咨詢：提品資料(說(shuō)明書(shū)、規(guī)格書(shū)等)

2、確認(rèn)檢測(cè)用途及項(xiàng)目要求

3、填寫檢測(cè)申請(qǐng)表(含公司信息及產(chǎn)品必要信息)

4、按要求寄送樣品(部分可上門取樣/檢測(cè))

5、收到樣品，安排費(fèi)用后進(jìn)行樣品檢測(cè)

6、檢測(cè)出相關(guān)數(shù)據(jù)，編寫報(bào)告草件，確認(rèn)信息是否無(wú)誤

7、確認(rèn)完畢后出具報(bào)告正式件

8、寄送報(bào)告原件