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010-82491398

報(bào)告問題解答:

010-8646-0567

檢測領(lǐng)域:

成分分析,配方還原,食品檢測,藥品檢測,化妝品檢測,環(huán)境檢測,性能檢測,耐熱性檢測,安全性能檢測,水質(zhì)檢測,氣體檢測,工業(yè)問題診斷,未知成分分析,塑料檢測,橡膠檢測,金屬元素檢測,礦石檢測,有毒有害檢測,土壤檢測,msds報(bào)告編寫等。

微生物群落結(jié)構(gòu)測定檢測

發(fā)布時(shí)間:2025-07-01

關(guān)鍵詞:微生物群落結(jié)構(gòu)測定測試儀器,微生物群落結(jié)構(gòu)測定測試標(biāo)準(zhǔn),微生物群落結(jié)構(gòu)測定測試周期

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來源:北京中科光析科學(xué)技術(shù)研究所

文章簡介:

微生物群落結(jié)構(gòu)測定檢測通過高通量測序、生物信息學(xué)分析等技術(shù)手段,全面解析樣品中微生物種類、豐度及多樣性特征。關(guān)鍵檢測要點(diǎn)包括DNA提取質(zhì)量控制、PCR擴(kuò)增特異性驗(yàn)證、序列聚類精度控制及數(shù)據(jù)庫比對準(zhǔn)確性,為環(huán)境微生物研究、工業(yè)菌群監(jiān)控提供科學(xué)依據(jù)。
點(diǎn)擊咨詢

因業(yè)務(wù)調(diào)整,部分個(gè)人測試暫不接受委托,望見諒。

檢測項(xiàng)目

16S rRNA基因測序:采用V3-V4高變區(qū)擴(kuò)增,檢測引物為341F/806R,測序深度≥50,000 reads/樣本

ITS區(qū)域真菌分析:針對ITS1/ITS2區(qū)域擴(kuò)增,引物組合ITS5/ITS4,分辨率達(dá)屬水平

α多樣性指數(shù)測定:包含Shannon指數(shù)(范圍0-10)、Chao1指數(shù)(>95%置信區(qū)間)及Simpson指數(shù)(0-1區(qū)間)

β多樣性分析:執(zhí)行Bray-Curtis距離矩陣計(jì)算(精度0.001)及PCoA三維排序

物種組成譜分析:基于SILVA138數(shù)據(jù)庫進(jìn)行門/綱/目級分類,最低置信閾值97%

功能基因預(yù)測:應(yīng)用PICRUSt2算法預(yù)測KEGG通路,置信度≥0.8

病原微生物篩查:針對沙門氏菌/大腸桿菌等設(shè)置特異性標(biāo)記基因,檢出限100CFU/mL

絕對定量分析:采用qPCR同步檢測16S拷貝數(shù),動態(tài)范圍102-10? copies/μL

抗性基因檢測:通過ARGs-OAP數(shù)據(jù)庫篩查200+抗生素抗性基因,覆蓋率≥90%

群落結(jié)構(gòu)網(wǎng)絡(luò)分析:構(gòu)建Spearman相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)(|r|>0.6, p<0.01)

檢測范圍

環(huán)境水體微生物:涵蓋地表水/地下水/廢水等樣品類型,檢測范圍10?-10? cells/L

土壤生態(tài)系統(tǒng):適用于農(nóng)田/林地/荒漠等土壤樣本,最低檢測量0.5g干重

發(fā)酵工業(yè)體系:包括酒類/乳制品/調(diào)味品發(fā)酵菌群動態(tài)監(jiān)測

人體微生態(tài)樣本:腸道/口腔/皮膚菌群采樣體積≥200μL

生物膜分析:針對管道/醫(yī)療器械表面生物膜,取樣面積4cm2

空氣微生物監(jiān)測:空氣采樣器捕獲粒徑0.5-10μm顆粒物

極端環(huán)境樣本:適應(yīng)高鹽/高溫/強(qiáng)酸等特殊環(huán)境微生物檢測

污染物降解菌群:石油烴/農(nóng)藥降解體系微生物組成解析

水產(chǎn)養(yǎng)殖系統(tǒng):養(yǎng)殖水體/底泥/生物體表菌群同步檢測

食品藥品安全:即食食品/藥品原料微生物污染溯源分析

檢測標(biāo)準(zhǔn)

ISO 17764-2:2007 動物飼料脂肪酸組成分析法

ISO 4833-1:2013 食品和飼料中微生物計(jì)數(shù)通則

GB/T 38578-2020 水體微生物多樣性調(diào)查技術(shù)規(guī)范

GB 4789.2-2016 食品安全國家標(biāo)準(zhǔn) 菌落總數(shù)測定

EPA/600/R-19/197 環(huán)境微生物群落表征方法指南

ASTM D4249-18 水中微生物采樣標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范

GB/T 36389-2018 高通量基因測序樣本制備質(zhì)量控制

ISO 17604:2015 動物胴體表面微生物取樣方法

ISO 18593:2018 食品接觸表面微生物采樣技術(shù)

GB/T 39665-2020 微生物宏基因組測序數(shù)據(jù)分析流程

檢測儀器

Illumina NovaSeq 6000測序系統(tǒng):雙通道流動槽實(shí)現(xiàn)PE150測序,單次產(chǎn)出6Tb數(shù)據(jù)

QuantStudio 7 Pro實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀:支持高通量384孔板,溫控精度±0.1℃

MP Biomedicals FastPrep-24樣品均質(zhì)儀:6×4 mL管位設(shè)計(jì),破碎速度1-12 m/s

Beckman Coulter Biomek i7自動化工作站:96通道移液臂實(shí)現(xiàn)核酸提取全程自動化

Agilent 4200 TapeStation生物分析儀:通過DNA ScreenTape檢測片段大?。?5-1000 bp)

Thermo NanoDrop One微量紫外分光光度計(jì):檢測體積0.5-2 μL,A260/A280精度±0.1

Eppendorf Centrifuge 5430R高速冷凍離心機(jī):最大轉(zhuǎn)速15,000 rpm,溫控范圍-20°C至40°C

Coy Laboratory厭氧操作工作站:氧濃度控制<1 ppm,適用于嚴(yán)格厭氧菌處理

檢測流程

1、咨詢:提品資料(說明書、規(guī)格書等)

2、確認(rèn)檢測用途及項(xiàng)目要求

3、填寫檢測申請表(含公司信息及產(chǎn)品必要信息)

4、按要求寄送樣品(部分可上門取樣/檢測)

5、收到樣品,安排費(fèi)用后進(jìn)行樣品檢測

6、檢測出相關(guān)數(shù)據(jù),編寫報(bào)告草件,確認(rèn)信息是否無誤

7、確認(rèn)完畢后出具報(bào)告正式件

8、寄送報(bào)告原件

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